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_() (PourPy.System method) (PourPy.system.System method) __author__ (in module PourPy) __copyright__ (in module PourPy) __credits__ (in module PourPy) __license__ (in module PourPy) __str__() (PourPy.Database method) (PourPy.database.Database method) (PourPy.Reactant method), [1], [2] (PourPy.reactant.Reactant method) (PourPy.Reaction method), [1] (PourPy.reaction.Reaction method) (PourPy.System method) (PourPy.system.System method) _average_values() (PourPy.pourbaix.PourbaixDiagram method) (PourPy.PourbaixDiagram method) _balanced_atoms() (PourPy.Reaction method), [1] (PourPy.reaction.Reaction method) _balanced_charge() (PourPy.Reaction method), [1] (PourPy.reaction.Reaction method) _compute_boundary_lines() (PourPy.pourbaix.PourbaixDiagram static method) (PourPy.PourbaixDiagram static method) _compute_intersections() (PourPy.pourbaix.PourbaixDiagram method) (PourPy.PourbaixDiagram method) _construct_stability_regions() (PourPy.pourbaix.PourbaixDiagram method) (PourPy.PourbaixDiagram method) _get_atoms() (PourPy.Reactant method), [1], [2] (PourPy.reactant.Reactant method) _get_bokeh_plot() (PourPy.pourbaix.PourbaixDiagram method) (PourPy.PourbaixDiagram method) _get_charge() (PourPy.Reactant method), [1], [2] (PourPy.reactant.Reactant method) _get_echem_reaction() (PourPy.Reaction method), [1] (PourPy.reaction.Reaction method)

_get_elements() (PourPy.System method) (PourPy.system.System method) _get_formula() (PourPy.Reactant method), [1], [2] (PourPy.reactant.Reactant method) _get_Hlimit() (PourPy.Reaction method), [1] (PourPy.reaction.Reaction method) _get_matplotlib_plot() (PourPy.pourbaix.PourbaixDiagram method) (PourPy.PourbaixDiagram method) _get_molecular_weight() (PourPy.Reactant method), [1], [2] (PourPy.reactant.Reactant method) _get_pH_reaction() (PourPy.Reaction method), [1] (PourPy.reaction.Reaction method) _get_pourbaixLine() (PourPy.Reaction method), [1] (PourPy.reaction.Reaction method) _get_reactant_string() (PourPy.Reactant method), [1], [2] (PourPy.reactant.Reactant method) _get_reaction_string() (PourPy.Reaction method), [1] (PourPy.reaction.Reaction method) _get_reactions() (PourPy.System method) (PourPy.system.System method) _get_state() (PourPy.Reactant method), [1], [2] (PourPy.reactant.Reactant method) _get_sub_string() (PourPy.Reactant method), [1], [2] (PourPy.reactant.Reactant method) _get_super_string() (PourPy.Reactant method), [1], [2] (PourPy.reactant.Reactant method) _get_unique_constitutents() (PourPy.pourbaix.PourbaixDiagram method) (PourPy.PourbaixDiagram method) _polar_angle() (PourPy.pourbaix.PourbaixDiagram method) (PourPy.PourbaixDiagram method) _sanity_check() (PourPy.Reaction method), [1] (PourPy.reaction.Reaction method) _set_aqueous_activity() (PourPy.System method) (PourPy.system.System method)

A

activity (PourPy.common.Defaults attribute) (PourPy.Defaults attribute), [1], [2] add_elements() (PourPy.System method) (PourPy.system.System method) add_reactions() (PourPy.Database method) (PourPy.database.Database method) (PourPy.System method) (PourPy.system.System method)

aqueous (PourPy.common.State attribute) (PourPy.State attribute), [1] associate_reactions_to_database() (PourPy.Database method) (PourPy.database.Database method) atoms (PourPy.Reactant attribute), [1], [2] (PourPy.reactant.Reactant attribute)

C

charge (PourPy.Reactant attribute), [1], [2] (PourPy.reactant.Reactant attribute) check_pH() (PourPy.pourbaix.PourbaixDiagram method) (PourPy.PourbaixDiagram method) Constants (class in PourPy), [1] (class in PourPy.common)

constituents (PourPy.Reaction attribute), [1] (PourPy.reaction.Reaction attribute) construct_reactions_from_reactants() (PourPy.System method) (PourPy.system.System method)

D

Database (class in PourPy) (class in PourPy.database) DefaultParser (class in PourPy), [1] (class in PourPy.parser) Defaults (class in PourPy), [1], [2] (class in PourPy.common) deltaE (PourPy.System property) (PourPy.system.System property) dGf (PourPy.Reactant attribute), [1], [2] (PourPy.reactant.Reactant attribute)

dGr (PourPy.Reaction property), [1] (PourPy.reaction.Reaction property) dHf (PourPy.Reactant attribute), [1], [2] (PourPy.reactant.Reactant attribute) dHr (PourPy.Reaction property), [1] (PourPy.reaction.Reaction property) dSr (PourPy.Reaction property), [1] (PourPy.reaction.Reaction property)

E

E0 (PourPy.Reaction property), [1] (PourPy.reaction.Reaction property) electrode_potentials (PourPy.System property) (PourPy.system.System property) electron (PourPy.common.State attribute) (PourPy.State attribute), [1] element_list (in module PourPy) (in module PourPy.database)

elements (in module PourPy.database) (PourPy.Database attribute) (PourPy.database.Database attribute) (PourPy.System attribute) (PourPy.system.System attribute) Emax (PourPy.System property) (PourPy.system.System property) Emin (PourPy.System property) (PourPy.system.System property)

F

FARADAY (PourPy.common.Constants attribute) (PourPy.Constants attribute), [1] formula (PourPy.Reactant attribute), [1], [2] (PourPy.reactant.Reactant attribute)

from_default() (PourPy.Database class method) (PourPy.database.Database class method) from_file() (PourPy.Database class method) (PourPy.database.Database class method)

G

GAS (PourPy.common.Constants attribute) (PourPy.Constants attribute), [1] gaseous (PourPy.common.State attribute) (PourPy.State attribute), [1]

get_stable_phase_at() (PourPy.pourbaix.PourbaixDiagram method) (PourPy.PourbaixDiagram method) get_stable_phases() (PourPy.pourbaix.PourbaixDiagram method) (PourPy.PourbaixDiagram method)

I

initialize() (PourPy.Reactant method), [1], [2] (PourPy.reactant.Reactant method) (PourPy.Reaction method), [1] (PourPy.reaction.Reaction method) (PourPy.System method) (PourPy.system.System method)

inspectorMode (PourPy.pourbaix.PourbaixDiagram attribute) (PourPy.PourbaixDiagram attribute)

K

K (PourPy.Reaction property), [1] (PourPy.reaction.Reaction property)

L

liquid (PourPy.common.State attribute) (PourPy.State attribute), [1]

M

maximum_electrode_potential (PourPy.common.Defaults attribute) (PourPy.Defaults attribute), [1], [2] maximum_pH_value (PourPy.common.Defaults attribute) (PourPy.Defaults attribute), [1], [2] minimum_electrode_potenital (PourPy.common.Defaults attribute) (PourPy.Defaults attribute), [1], [2] minimum_pH_value (PourPy.common.Defaults attribute) (PourPy.Defaults attribute), [1], [2] module PourPy PourPy.common PourPy.database PourPy.parser PourPy.pourbaix PourPy.reactant PourPy.reaction PourPy.system

MW (PourPy.Reactant attribute), [1], [2] (PourPy.reactant.Reactant attribute)

N

nElectrons (PourPy.Reaction property), [1] (PourPy.reaction.Reaction property)

nProtons (PourPy.Reaction property), [1] (PourPy.reaction.Reaction property)

P

parse_elements() (PourPy.DefaultParser static method), [1] (PourPy.parser.DefaultParser static method) (PourPy.parser.Parser method) parse_reaction() (PourPy.DefaultParser static method), [1] (PourPy.parser.DefaultParser static method) parse_reactions() (PourPy.DefaultParser static method), [1] (PourPy.parser.DefaultParser static method) (PourPy.parser.Parser method) parse_specie() (PourPy.DefaultParser static method), [1] (PourPy.parser.DefaultParser static method) parse_species() (PourPy.DefaultParser static method), [1] (PourPy.parser.DefaultParser static method) (PourPy.parser.Parser method) Parser (class in PourPy.parser) parser (PourPy.Database attribute) (PourPy.database.Database attribute) pHmax (PourPy.System property) (PourPy.system.System property) pHmin (PourPy.System property) (PourPy.system.System property) pHs (PourPy.System property) (PourPy.system.System property)

PourbaixDiagram (class in PourPy) (class in PourPy.pourbaix) PourPy module PourPy.common module PourPy.database module PourPy.parser module PourPy.pourbaix module PourPy.reactant module PourPy.reaction module PourPy.system module pressure (PourPy.common.Defaults attribute) (PourPy.Defaults attribute), [1], [2] (PourPy.System property) (PourPy.system.System property)

Q

Q (PourPy.Reaction property), [1] (PourPy.reaction.Reaction property)

QpH (PourPy.Reaction property), [1] (PourPy.reaction.Reaction property)

R

Reactant (class in PourPy), [1], [2] (class in PourPy.reactant) Reaction (class in PourPy), [1] (class in PourPy.reaction) reactions (PourPy.System attribute) (PourPy.system.System attribute) read_parameters_from_file() (PourPy.System method) (PourPy.system.System method) read_reactions_from_file() (PourPy.System method) (PourPy.system.System method) reference_abbreviation (PourPy.System property) (PourPy.system.System property)

reference_electrode (PourPy.System property) (PourPy.system.System property) reference_electrode_abbreviation (PourPy.common.Defaults attribute) (PourPy.Defaults attribute), [1], [2] reference_electrodes (PourPy.common.Defaults attribute) (PourPy.Defaults attribute), [1], [2] reference_potential_difference (PourPy.common.Defaults attribute) (PourPy.Defaults attribute), [1], [2] rQ (PourPy.Reaction property), [1] (PourPy.reaction.Reaction property)

S

set_aqueous_activity() (PourPy.System method) (PourPy.system.System method) set_database() (PourPy.System method) (PourPy.system.System method) show() (PourPy.pourbaix.PourbaixDiagram method) (PourPy.PourbaixDiagram method) Sm (PourPy.Reactant attribute), [1], [2] (PourPy.reactant.Reactant attribute) solid (PourPy.common.State attribute) (PourPy.State attribute), [1] solve() (PourPy.pourbaix.PourbaixDiagram method) (PourPy.PourbaixDiagram method) species (PourPy.Database attribute) (PourPy.database.Database attribute) stable_regions (PourPy.pourbaix.PourbaixDiagram attribute) (PourPy.PourbaixDiagram attribute)

STANDARD_PRESSURE (PourPy.common.Constants attribute) (PourPy.Constants attribute), [1] STANDARD_TEMPERATURE (PourPy.common.Constants attribute) (PourPy.Constants attribute), [1] State (class in PourPy), [1] (class in PourPy.common) state (PourPy.Reactant attribute), [1], [2] (PourPy.reactant.Reactant attribute) System (class in PourPy) (class in PourPy.system) system (PourPy.pourbaix.PourbaixDiagram attribute) (PourPy.PourbaixDiagram attribute) (PourPy.Reaction attribute), [1] (PourPy.reaction.Reaction attribute)

T

temperature (PourPy.common.Defaults attribute) (PourPy.Defaults attribute), [1], [2] (PourPy.System property) (PourPy.system.System property)

W

write_parameters_to_file() (PourPy.System method) (PourPy.system.System method)